Flutikasonia käytetään ehkäisemään ja hoitamaan kausittain tai ympärivuotisesti esiintyvän allergisen nuhan oireita.
Kausiluonteisen allergisen nuhan hoidossa saavutetaan parempi hoitotulos, jos lääkitys aloitetaan muutamaa päivää ennen oletettua altistumista.

Flixonase-nenäsumutteen vaikuttavan aineen, flutikasonipropionaatin, vaikutus perustuu sen nenän limakalvotulehdusta hoitavaan ominaisuuteen. Samalla nenän limakalvoturvotus vähenee.